生物化学第四章酶生物化学第一节酶的性质生物化学一、酶是生物催化剂安塞姆.佩恩（法国，1833）麦芽水提物淀粉可溶性糖水解乙醇沉淀对热不稳定催化剂？生物化学1878库恩（德国）Enzyme酶-“在酵母中”一、酶是生物催化剂生物化学刀豆脲酶结晶第一个酶结晶，证明酶是蛋白质1946年诺贝尔化学奖詹姆斯.萨姆纳（美国，1926）一、酶是生物催化剂生物化学发现具有催化活性的RNA1989诺贝尔化学奖奥特曼切赫（美国，1982）一、酶是生物...
4-1酶的性质大家好，我是你们的主讲老师，今天我们一起来学习酶的性质。生物体具有生命活动，那么就需要有新陈代谢，而新陈代谢是指生命体内的物质能量代谢，包括合成代谢和分解代谢，正是因为有了新陈代谢，我们的细胞组织才能得到更新。就好比我们人必需摄取食物，食物在体内分解成我们所需的物质，并提供能量；同时将那些衰老的细胞组织排出体外，在这个过程中必不可少的物质是酶，可以说没有酶就没有生命，那什么是酶呢？酶...
RNARNA核糖体RNA（ribosomalRNA，rRNA）转运RNA（transferRNA，tRNA）信使RNA（messengerRNA，mRNA）DNA与RNA结构对比1.与DNA相比，RNA相对分子质量较小，大多数RNA是一条单链，。2.RNA分子中A与U，G与C配对，碱基能配对的区域形成双螺旋，不能配对的区域形成突环，因此不遵守碱基当量定律。3.局部螺旋比例越大，RNA分子越稳定。tRNA>rRNA>mRNA一、tRNA的分子结构（一）三种稀有核苷OHHOHOHHHOH2CHHNNOO二氢尿嘧啶核苷（DHU）OH...
2-7RNA的分子结构大家好，我是你们的主讲老师王杨，今天我们来学习RNA的分子结构。细胞质的RNA，通常按其在蛋白质合成中所起的作用主要分为3种类型，分别是核糖体RNA（rRNA），转运RNA（tRNA）和信使RNA（mRNA）。RNA和DNA相比有以下一些异同，第一，与DNA相比，RNA的相对分子质量较小，大多数RNA是一条单链，第二，2.RNA分子中A与U，G与C配对，碱基能配对的区域形成双螺旋，不能配对的区域形成突环，因此不遵守碱基当量定律。...
大家好，我是你们的主讲老师王杨，上节课我们为大家介绍了核酸的研究历史，并知道了核酸的基本组成单位是核苷酸，那么核苷酸究竟是什么样的物质呢？今天我们就一起来学习。核苷酸由三个部分组成，分别是磷酸、核糖和碱基，其中核糖和碱基组成的部分又称之为核苷。而根据所含碱基和核糖的不同，我们可以得到多种不同的核苷酸。核苷酸中的碱基根据结构的不同可以分为两种，分别是嘌呤和嘧啶，再根据取代基的不同分为腺嘌呤、鸟嘌...
核苷酸大家好，我是你们的主讲老师王杨，今天我们一起开始学习第二章核酸化学，说起核酸，我们会想到DNA，也就是脱氧核糖核酸，还有RNA，也就是核糖核酸，我们知道核酸是一种遗传物质，具有储存和传递遗传信息的功能，那么核酸究竟是由什么物质组成的呢？下面我们一起来看看吧。首先，我们来看一下前人对于核酸的研究历史。这两位科学家分别是来自奥地利的孟德尔，和来自瑞士的米歇尔。他们是同一时期的科学家，为什么把他们放...
第六章生物氧化第六章生物氧化第一节、生物氧化的特点第二节、生物氧化的本质及过程第三节、NADH和FADH2的彻底氧化第一节、生物氧化概念指有机物在生物体内（细胞内）氧化分解成CO2和H2O并释放出能量形成ATP的过程。包括物质分解和产能：呼吸作用O2CO2+H2O细胞呼吸（微生物）脂肪葡萄糖、其它单糖三羧酸循环电子传递（氧化）蛋白质脂肪酸、甘油多糖氨基酸乙酰CoAe-磷酸化+Pi小分子化合物分解成共同的中间产物（如丙酮酸、乙酰Co...
生物化学Biochemistry第九章、核苷酸代第一节、核酸的酶促降解第二节、核苷酸的分解第三节、核苷酸的生物合成三、核苷酸的生物合成三、核苷酸的生物合成1、嘌呤核苷酸的生物合成过程（1）嘌呤核苷酸环上原子来源三、核苷酸的生物合成1、嘌呤核苷酸的生物合成过程（2）嘌呤核苷酸合成特点从5-P-核糖开始的，在ATP参与下先形成PRPP（焦磷酸激酶）先形成IMP，然后在单磷酸的水平上转变成AMP、GMP。嘌呤的各个原子是在PRPP...
生物化学Biochemistry第七章、脂类代第一节、脂类概述第二节、酶的作用机制第三节、酶的分离纯化脂肪的生物合成1、脂肪酸的生物合成生物机体内脂类的合成是十分活跃的，特别是在高等动物的肝脏、脂肪组织和乳腺中占优势。脂肪酸合成的碳源主要来自糖酵解产生的乙酰CoA。脂肪酸合成步骤与氧化降解步骤完全不同。脂肪酸的生物合成是在细胞溶胶中进行，需要CO2和柠檬酸参加；而氧化降解是在线粒体中进行的。CoA转酰酶脂肪的生物合...
生物化学Biochemistry第六章、生物第一节、生物氧化的特点第二节、生物氧化的本质及过程第三节、NADH和FADH2的彻底氧化苯丙氨酸酪氨酸生物氧化的本质及过程1、本质生物氧化的本质是电子的得失，失电子者为还原剂，是电子供体，得电子者为氧化剂，是电子受体。在生物体内，它有三种方式：（1）加氧氧化（2）电子转移O2生物氧化的本质及过程1、本质（3）脱氢氧化CH3CHCOOHOHNAD+NADHCH3CCOOHO生物氧化的本质及过程2、生物能及其存...
生物化学Biochemistry第六章、生物第一节、生物氧化的特征第二节、生物氧化的本质及过程第三节、NADH和FADH2的彻底氧化生物氧化的特征指有机物在生物体内（细胞内）氧化分解成CO2和H2O并释放出能量形成ATP的过程。包括物质分解和产能：呼吸作用O2CO2+H2O细胞呼吸（微生物）脂肪葡萄糖、其它单糖三羧酸循环电子传递（氧化）蛋白质脂肪酸、甘油多糖氨基酸乙酰CoAe-磷酸化+Pi小分子化合物分解成共同的中间产物（如丙酮酸、乙酰CoA...
生物转化生物转化一、生物转化的定义生物转化是指一些非营养物质在体内的代谢转变过程。内源性：代谢产物及中间物(如胺类、胆红素)，待灭活的生物活性物质(如激素、神经递质)等；外源性：异物源，如药物、毒物等。生物转化体内非营养物质有内源性和外源性两类肝脏是生物转化最重要器官，在肺、肾、胃肠道和皮肤也有一定生物转化功能。生物转化二、生物转化的意义对体内的非营养物质(xenobiotics)进行转化，使其灭活(inact...
蛋白质序列的功能信息分析TargetpeptidePsort:http://psort.hgc.jp/TargerP:http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/Euk-mPLoc2.0:http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/BaCelLo:http://gpcr.biocomp.unibo.it/bacello/CELLO:http://cello.life.nctu.edu.tw/Club-Sub:http://toolkit.tuebingen.mpg.de/clubsubpADPhttp://phospho.elm.eu.orghttp://www.phosphosite.org/PhosphoELMPhosphoSiteNetPhos:http://www.c...
mRNADNADNADNAmRNADNADNA序列mRNA或蛋白质序列外显子内含子GTAGGTAGBLASTnBLASTxAATAnalysisandAnnotationToolhttp://www.tigr.org/software/software.htmlBysignalsBycontentsGT–AG3BysignalsCACCATGGCGTCGAATGTTABycontentsDNAFGENEHLinearDiscriminantAnalysisGeneIDRule-basedSystemGeneParserGRAILMZEFdecisiontreeGENSCANHMMGenieHMMGeneralizedHMMHMMgeneHMMGENSCANChrisBurge1997DNAGENSCANhttp://genes.mit.edu/GENSCAN.htmlGENSCANGENSCAN起始外显子终止外显子
真核生物RNA的成熟l真核生物转录生成的RNA分子是初级RNA转录物(primaryRNAtranscript)，几乎所有的初级RNA转录物都要经过加工，才能成为具有功能的成熟的RNA。l加工主要在细胞核中进行。mRNA转录后加工•加帽•加尾•剪接一、加帽l帽子结构：7-甲基鸟嘌呤。l加帽需要的酶：加帽酶(cappingenzyme)和甲基转移酶(methyltransferase)催化完成。l帽子结构的位置：大多数真核mRNA的5’-末端5pppGp5GpppGppppGppi鸟苷酸转移酶5m7...
BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST5BLASTBLASTNCBIBLASTBLAST+BLASTftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/BLAST②调取DOS命令③到达BLAST的bin目录下④建库⑤比对BLASTFTPBLASTBLASTBLASThttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/DOSwindows+Rcmd‖BLASTBLASTbin:cd[:][][]:―cd\‖——―cd..‖——cd‖BLASTbin“cd”BLASTBLASTbincd‖BLASTbinC:\ProgramFiles\NCBI\blast-2.7.1+\binD...
真核生物转录的特点种类ⅠⅡⅢ转录产物rRNA的前体45SrRNAmRNA前体hnRNA,lncRNA,piRNA,miRNAtRNA,5SrRNAsnRNA一、真核生物的RNA聚合酶与原核生物相比较，真核生物的RNA聚合酶种类多，分别用于不同RNA的转录。二、真核生物转录起始Ø与原核生物相比，真核生物的转录起始需要大量的转录因子，起始过程更复杂。Ø转录因子：参与转录的蛋白质因子称为转录因子（transcriptionalfactors,TF）。Ø转录因子中，所有基因均需要的转录因子...
BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST2BLASTBLASTBLASTPCRNeedleman-WunschTPubChemBioAssayBLASTSmartBLAST找到与查询高度相似的蛋白质针对特定PCR模板设计引物双序列全局比对（Needleman-Wunsch）在序列中查找保守的域查找基因表达谱的匹配项搜索免疫球蛋白和T细胞受体序列搜索序列的载体污染查找具有类似保守域的序列搜索用于系统发育分析的标记使用结构域和蛋白质限制进行多序列比对在PubChemBioAssay中搜索蛋白质...
原核生物的转录过程RNA聚合酶识别并结合转录的起始区域，解链并形成转录起始复合物。一、转录起始原核生物转录过程转录起始、转录延长、转录终止-35-10+1Step1：形成闭合转录复合体holoenzymeStep2：形成开放转录复合体Step3：生成第一个3‘5’磷酸二酯键，形成转录起始复合物RNApol全酶(2ω)-DNA-pppGpN-OH3转录起始复合物Ø在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应，形成第一个磷酸二酯键：5-pppG-OH+NTP5...
BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST5BLASTPSI-BLASTPSI-BLASTPositionSpecificIterativeBLASTBLASTPPSSM(position-specificscoringmatrix)0BLASTPSI-BLASTYY1PSI-BLAST1PSI-BLAST2PSSMPSI-BLAST342516PHI-BLASTPHI-BLASTPattern-HitInitiatedBLASTBLASTPatternPSI-BLASTYY1PHI-BLASTPROSITESCANhttps://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_proscan.htmlYY1FASTAC2H2PHI-BLASTIUPACx[]{},-<N...
